A Naboo bolygón a háború veszélye fenyegeti a Köztársaságot, mivel a Naboo-iak és a Gungan-ek külön-külön tagjai a Köztársaságnak, ezért a Gungan-ek vezére a Szeparatisták-hoz akar csatlakozni, akik idő közben megérkeznek a bolygóra. Viszont az egyik gungan mágiával irányítja a vezért, amelyet Anakin-nak sikerül megtörnie. És miközben az árulót követi Anakin, Grievous előkészíti a seregét a Naboo elfoglalására. Vajon a Gungan-ek elég ideig ki tudnak tartani Grievous tábornokkal szemben, amíg a klónok megérkeznek?